home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9408a.zip / M9480120.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-09  |  3KB  |  41 lines
  1.        Document 0120
  2.  DOCN  M9480120
  3.  TI    Phylogenetic relationship between human immunodeficiency virus type 1
  4.        (HIV-1) long terminal repeat natural variants present in the lymph node
  5.        and peripheral blood of three HIV-1-infected individuals.
  6.  DT    9410
  7.  AU    Ait-Khaled M; Emery VC; Division of Communicable Diseases, Royal Free
  8.        Hospital School of; Medicine, Hampstead, London, U.K.
  9.  SO    J Gen Virol. 1994 Jul;75 ( Pt 7):1615-21. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/94292912
  11.  AB    PCR has been used to amplify a 540 base pair fragment of the human
  12.        immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) long terminal repeat region
  13.        encompassing the U5/R/U3 regions from proviral HIV DNA that was present
  14.        in the lymph nodes and peripheral blood mononuclear cells of three
  15.        HIV-infected individuals. The resulting PCR products were cloned and the
  16.        DNA sequence of multiple clones from each reaction was determined to
  17.        enable the distribution and phylogenetic relationship between the
  18.        variants in each body site to be assessed. The results of bootstrapped
  19.        parsimony phylogenetic analyses showed that a distinct polarization was
  20.        evident between peripheral blood and lymph node variants in the patient
  21.        who possessed a histologically intact lymph node. In contrast, similar
  22.        analyses conducted on samples from two patients with extensive lymph
  23.        node disruption showed similar variants in lymph node and peripheral
  24.        blood. In the patient with an intact lymph node, lymph node variants
  25.        were significantly more heterogeneous than those present in blood
  26.        samples taken either simultaneously or 11 months later. No differences
  27.        in heterogeneity between lymph node and peripheral blood were observed
  28.        in patients with disrupted lymph nodes. The significance of these
  29.        results for our understanding of HIV pathogenesis is discussed.
  30.  DE    Base Sequence  Cloning, Molecular  Consensus Sequence  DNA,
  31.        Viral/ANALYSIS/BLOOD  Human  HIV Infections/*MICROBIOLOGY  HIV Long
  32.        Terminal Repeat/*GENETICS  HIV-1/*GENETICS  Leukocytes,
  33.        Mononuclear/MICROBIOLOGY  Lymph Nodes/MICROBIOLOGY  Molecular Sequence
  34.        Data  *Phylogeny  Polymerase Chain Reaction  Proviruses/GENETICS
  35.        Sequence Alignment  Sequence Analysis, DNA  Support, Non-U.S. Gov't
  36.        Variation (Genetics)/*GENETICS  JOURNAL ARTICLE
  37.  
  38.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  39.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  40.  
  41.